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第三層非常複雜，是Nepomuk 被視為歐盟（European union）多個公司和大學研究項目的原因。這部分你會遇到很難理解的詞組像是'語義桌面（semantic desktop）'和'本體論（ontologies）'。基本上，它涉及到語境（context）和關係（relationships)。